Please use this identifier to cite or link to this item: http://rdcb.cbg.ipn.mx/handle/20.500.12273/758
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.rights.licensehttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0es_MX
dc.contributorPARRA BRACAMONTE, GASPAR MANUEL-
dc.contributor.otherInstituto Politécnico Nacional-
dc.creatorJAHUEY MARTÍNEZ, FRANCISCO JOEL-
dc.date.accessioned2020-07-17T20:34:04Z-
dc.date.available2020-07-17T20:34:04Z-
dc.date.issued2018-06-
dc.identifier.urihttp://rdcb.cbg.ipn.mx/handle/20.500.12273/758-
dc.description.abstractEn ganado bovino, las características de importancia productiva son caracteres complejos, es decir, son influenciados por factores genéticos y ambientales, por lo que no siguen un patrón de herencia simple. En los sistemas de cría tradicional, el mejoramiento genético de estos caracteres se realiza seleccionando individuos en base a su mérito genético. Sin embargo, las nuevas tecnologías de genotipificación que utilizan miles de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) han traído nuevas oportunidades para el estudio y evaluación genética de animales domésticos a través del método denominado “genoma completo”. Este trabajo comprende el análisis genómico (mapeo genético y predicción) de características de importancia productiva en ganado bovino Charolais mediante el uso de un panel de 77 mil SNP. En el capítulo I se describe el mapeo genético de características de crecimiento (pesos corporales) mediante análisis de asociación de genoma completo (GWAS, por sus siglas en inglés). En este primer estudio se lograron identificar 18 marcadores genéticos asociados a las características estudiadas. Algunos SNP identificados mediante GWAS se localizaron cerca de genes funcionalmente relacionados con el crecimiento, entre ellos los genes TRAF6 (Factor 6 receptor asociado a TNF); CDH11 (Caderina 11, tipo 2, OB- caderina (osteoblasto)); KLF7 (Factor 7 tipo Kruppel (ubicuo)); MIR181A-1 (microRNA mir-181a-1); y adicionalmente PRCP (prolilcarboxipeptidasa [angiotensinasa C]), localizados en los cromosomas 15; 18; 2; 16; y 29, respectivamente. En el capítulo II se muestran los resultados de la identificación de señales de selección (GWSS, por sus siglas en inglés) mediante análisis de haplotipos. En este estudio se identificaron 10 SNP localizados en los cromosomas 1, 4, 6, 7 y 14. Particularmente, las señales de selección identificadas en los cromosomas 6 y 14 corresponden a regiones comúnmente reportadas en la literatura conteniendo locus (NCAPG-LCORL y PLAG1) asociados a una amplia variedad de características de importancia productiva, entre ellas el crecimiento. Tres nuevas regiones bajo selección se reportan en este estudio para ganado bovino Charolais, las cules se localizan en 131.4-133.5 Mb, 51.8-60.3 Mb y 28.2-31.1 Mb de los cromosomas 1, 4 y 7, respectivamente. En estas regiones destacaron los genes CAV1 (caveolina 1), CAV2 (caveolina 1), MDFIC (proteína que contiene el dominio inhibidor MyoD), IFDR1 (regulador del desarrollo 1 relacionado a interferón) y ZNF608 (proteína dedo de cinc 608). Finalmente, en el capítulo III se describen los resultados del análisis de predicción de características de crecimiento mediante los métodos GBLUP, BayesC y SSBR. Este último estudio mostró que la exactitud de predicción de los métodos genómicos no fue superior a la obtenida mediante BLUP (método basado en el pedigrí). En este estudio diferentes factores como la estructura de los datos, el tamaño de la población y la calidad de las variables de respuesta pudieron haber influído en el desempeño de los marcadores genéticos para predecir las características fenotípicas.es_MX
dc.language.isospaes_MX
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_MX
dc.titleAnálisis de genoma completo y predicción genómica para caracteres complejos en bovinos Charolaises_MX
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesises_MX
dc.creator.id421729es_MX
dc.contributor.id201219es_MX
dc.contributor.roleasesorTesises_MX
dc.contributor.oneSIFUENTES RINCON, ANA MARIA-
dc.contributor.idone79216es_MX
dc.contributor.roleoneasesorTesises_MX
dc.subject.ctiinfo:eu-repo/classification/cti/6es_MX
dc.subject.keywordsGenoma completoes_MX
dc.subject.keywordspredicción genómicaes_MX
dc.subject.keywordsbovinos Charolaises_MX
dc.subject.keywordsReynosaes_MX
dc.type.uri10.1111/jbg.12399es_MX
dc.publisher.universityInstituto Politécnico Nacional-CBG (Centro de Biotecnología Genómica)es_MX
dc.educationLevel.degreeDoctoradoes_MX
dc.relation.articlesSignatures of selection in Charolais beef cattle identified by genome-wide analysises_MX
Appears in Collections:Tesis

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
TESIS 2018 F JJahuey M.pdfTesis3.09 MBAdobe PDFView/Open


Items in RI-CBGIPN are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.